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                小反芻獸疫病毒檢測試劑盒-PCR法

                更新時(shí)間:2023-05-16      瀏覽次數(shù):1005

                【檢驗(yàn)原理】

                本試劑盒針對小反芻獸疫病毒的高度保守區(qū)域設(shè)計(jì)特異性引物和探針,在反應(yīng)體系中含小反芻獸疫病毒基因組模板的情況下,PCR反應(yīng)得以進(jìn)行并釋放熒光信號(hào)。利用熒光定量PCR儀對PCR過程中相應(yīng)通道信號(hào)進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測和輸出,實(shí)現(xiàn)檢測結(jié)果的定性分析。

                【主要組成成份】

                序號(hào)

                組成

                25T/盒

                50T/盒

                1

                PPRV  RT-PCR反應(yīng)液

                437.5 μL×1管

                875 μL×1管

                2

                PPRV 混合酶液

                62.5 μL×1管

                125 μL×1管

                3

                PPRV 陽性對照

                40 μL×1管

                 40 μL×1管

                4

                PPRV 陰性對照

                40 μL×1管

                 40 μL×1管

                5

                說明書

                1份

                1份

                注:陰性對照為偶蹄獸類基因組DNA,陽性對照為失去活性的小反芻獸疫病毒cDNA

                【儲(chǔ)存條件及有效期】避光-20℃以下保存,避免反復(fù)凍融,有效期12個(gè)月。

                【適用儀器】ABI 系列、Bio-Rad系列、Agilent Stratagene MX系列 、Roche LightCycler R480、Cepheid SmartCycler、Rotor-Gene系列、杭州博日系列等多通道實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀。

                【樣本要求】

                1. 適用標(biāo)本類型:發(fā)病動(dòng)物血液、空腸及小腸腸內(nèi)容物及組織臟器(腸道組織、腸系膜及淋巴結(jié)等)和病毒培養(yǎng)液。

                2. 標(biāo)本采集,方法如下:

                (1) 血清:用一次性注射器取靜脈血2-3ml,轉(zhuǎn)至5ml 的干燥管中,密閉送檢。

                (2) 腸內(nèi)容物:無菌條件下取腸道內(nèi)容物約1g 左右,置入1ml 含有1.0ml PBS(或生理鹽水)5ml 離心管中,立即送檢。

                (3) 組織臟器:取發(fā)病動(dòng)物腸道組織及腸系膜淋巴結(jié)等組織約1g,置一1.5ml的潔凈離心管中,密閉送檢。

                3.應(yīng)避免標(biāo)本間交叉污染。

                4.標(biāo)本收集后可立即檢測;若不能立即檢測,可置于28℃冷藏過夜保存;如需長期保存,標(biāo)本應(yīng)凍存于-80以下,避免反復(fù)凍融。

                【檢驗(yàn)方法】

                1. 試劑準(zhǔn)備(試劑準(zhǔn)備區(qū))

                1)從冰箱中取出試劑盒, 從試劑盒中取出實(shí)驗(yàn)所需試劑,充分融化混勻并瞬時(shí)離心以去除管壁附著液體。

                2)核算當(dāng)次實(shí)驗(yàn)所需要的反應(yīng)數(shù)(n),并根據(jù)如下表所示反應(yīng)體系計(jì)算當(dāng)次實(shí)驗(yàn)所需要的各種試劑量。

                n =陰性對照數(shù)(1T)+陽性對照數(shù)(1T)+誤差預(yù)留量(1T)+樣本數(shù)

                單反液配制表

                RT-PCR反應(yīng)液

                17.5 μL

                混合酶液

                 2.5 μL

                 

                3)在無菌離心管中加入上述試劑,充分混勻后瞬時(shí)離心。按照20 μL/管分裝量將試劑分裝至PCR反應(yīng)管。

                2.樣本準(zhǔn)備(樣本處理區(qū))

                QIAGEN、Roche公司RNA提取試劑盒提取RNA,具體操作按照其試劑盒說明書操作。

                3.加樣

                在上述制備好的PCR反應(yīng)樣本管中分別加入處理好的待測標(biāo)本RNA各5 μl、終體積25 μl/管,蓋好PCR反應(yīng)蓋混勻后瞬時(shí)低速離心,轉(zhuǎn)移到PCR儀器上。陰性對照和陽性對照管則各加5 μL試劑盒自帶的陰性對照或陽性對照品,終體積為25 μl/管,蓋好PCR反應(yīng)蓋混勻后瞬時(shí)低速離心,轉(zhuǎn)移到PCR儀器上。

                4. PCR(PCR擴(kuò)增區(qū))

                1)取樣本處理區(qū)準(zhǔn)備好的PCR反應(yīng)管,放置在實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀樣品槽相應(yīng)位置,并記錄放置順序。

                2)按下表設(shè)置儀器核酸擴(kuò)增相關(guān)參數(shù)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。


                反應(yīng)體積

                25 μL

                通道選擇

                FAM通道采集小反芻獸疫病毒熒光信號(hào)

                PCR

                反應(yīng)

                條件

                步驟

                條件

                循環(huán)數(shù)

                反轉(zhuǎn)錄

                    50℃:10分鐘(min)

                1

                預(yù)變性

                95℃:3分鐘(min)

                1

                PCR擴(kuò)增

                95℃:5秒(s)

                40

                55℃:40秒(s)

                (此階段結(jié)束時(shí)采集熒光信號(hào))

                注:ABI系列熒光PCR儀在設(shè)置時(shí)不選ROX校正,設(shè)置淬滅基團(tuán)選擇None。

                【參考值(參考范圍)】

                1.試劑盒有效性判定:

                 1)陽性對照:有典型S型擴(kuò)增曲線或Ct值≤35。

                 2)陰性對照:Ct值>38或無Ct值,線形為直線或輕微斜線,無指數(shù)增長期。

                2.標(biāo)本結(jié)果判定:

                1)陽性:標(biāo)本檢測結(jié)果Ct值≤35或有明顯指數(shù)增長期。

                2)可疑:標(biāo)本檢測結(jié)果Ct值在3538范圍內(nèi)。此時(shí)應(yīng)對標(biāo)本進(jìn)行重復(fù)檢測,如重復(fù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果Ct值仍在3538范圍內(nèi),有明顯指數(shù)增長期,則判定為陽性,否則為陰性。

                3)陰性:標(biāo)本檢測結(jié)果Ct值>38或無Ct值。

                【檢驗(yàn)結(jié)果的解釋】

                通道及檢測結(jié)果

                標(biāo)本檢測結(jié)果解釋

                FAM

                陽性(+)

                標(biāo)本中檢出小反芻獸疫病毒RNA

                陰性(-)

                標(biāo)本中未檢出小反芻獸疫病毒RNA


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